COVID-19検出のヒント

新しいコロナウイルス（COVID-19）の検出とワクチンの研究開発をサポートするために、米国疾病対策予防センター（CDC）と中国政府は新しいコロナウイルスゲノムのシーケンシングを完了し、結果を米国NCBI GenBankに提出しました®データベース]。最近、IDTは新しいコロナウイルス検出キットについて世界中の研究者から問い合わせを受けました。以下は簡単な説明です。

米国疾病管理予防センター

米国疾病対策予防テストキットセンター* COVID-19ヌクレオカプシドタンパク質遺伝子（N-遺伝子）のさまざまな部位をターゲットにします。このキットの3セットのプライマー/プローブは、ヒトRNase P遺伝子をターゲットとする内部コントロールと同時に実行する必要があります。患者のサンプルごとに、合計 4 qPCRテストが必要です。

1。検出キットはワンステップqPCR反応を使用します（つまり、逆転写と後続のqPCR反応は同じステップで完了します）。

2。すべての 3 N遺伝子テストは、Cq 0010010 lt; 35;の場合にのみ肯定的な結果と見なすことができます。

3。 RNase Pの内部制御反応が重要です。 Cq 0010010 gt; 3 5は、サンプル抽出が適切ではなく、実験を繰り返す必要があることを意味します。

関連するドキュメントと実験プロトコルについては、最新の米国疾病対策管理センターCOVID-19 RT-PCR試験方法ラボガイドを参照してください。

他のテストキットとの比較

世界保健機関（WHO）

世界保健機関の実験プログラムは、米国疾病予防管理センターの実験プログラムとは異なります。世界保健機関は、COVID-19が感染しているかどうかを確認するために3つのqPCR反応を推奨しています。これは実験プロトコルの完全なセットですが、3つの連続したテストを必要とし、次のテストの前に肯定的な結果が観察される必要があるため、より高速なUS CDCテスト方法はありません。実験プロトコルは次の順序でテストされます。

1。コロナウイルスE-遺伝子

2。 RdRP遺伝子：SARSコロナウイルスおよび他のコウモリ関連コロナウイルスを標的とする

3。 RdRP遺伝子：COVID-19をターゲット

中国疾病予防管理センター

中国疾病対策予防センターの検出キットは、 2 プライマー/プローブのセットの使用を推奨しています。グループ 1 はORF 1 abをターゲットとし、グループ 2 はCOVID-19のN遺伝子を確認するために使用されます。

対照群

予備的な電子シミュレーション分析では、IDT N遺伝子陽性コントロールテンプレート**とUS CDCテストキットの組み合わせは、中国CDC、タイ保健省、およびHKUのプライマー/プローブセットの使用に類似していることが示されています。実験によると一貫しています。もちろん、これは電子シミュレーション研究に基づいており、ユーザーは自分の研究室で選択したキットを検証することをお勧めします。

詳細については、www.idtdna.com / pages / landing / coronavirus-research-reagentsをご覧ください。